Zasadniczym celem przedłożonego projektu jest: z jednej sprecyzowanie i podsumowanie zakresu reform ustrojowych UE zawartych w Traktacie z Lizbony, z drugiej zaś skoncentrowanie się na analizie tzw. działań implementacyjnych i rozwiązań przejściowych związanych z reformami UE wprowadzonymi na mocy Traktatu z Lizbony. W tej, zasadniczej części, projekt będzie koncentrował się na następujących zagadnieniach: 

• okresach przejściowych ustanowionych w Traktatach i Protokole (nr 36) (rozpoczęcie działania instytucji unijnych w nowym reżimie prawnym, nowej formule większości kwalifikowanej, statusie aktów prawnych byłego II i III filaru UE); 

• nowym balansie międzyinstytucjonalnym w UE (zwłaszcza między Radą Europejską, Radą UE, Parlamentem Europejskim i Komisją, przy uwzględnieniu roli Wysokiego Przedstawiciela, Prezydencji hybrydowej oraz „grupy euro”); 

• reprezentacji UE w stosunkach zewnętrznych (roli Wysokiego Przedstawiciela w kontekście pozycji Przewodniczącego Rady Europejskiej, przewodniczących PE i KE oraz na kwestii procedury zawierania umów międzynarodowych przez UE - zwłaszcza umów mieszanych); 

• umocnieniu roli parlamentów narodowych w sprawach UE (zwłaszcza na regulacjach krajowych dotyczących tzw. procedur kładek); 

• umocnieniu ochrony praw podstawowych w UE (zwłaszcza przystąpienie UE do EKPCz); 

• pozostałych, szczegółowych działań implementacyjnych (w tym dotyczących tzw. inicjatywy obywatelskiej, rozporządzeń unijnych dotyczących aktów delegowanych oraz monitorowania działalności Eurojastu i Europolu); w końcu 

• w ramach projektu uwzględniony zostanie wpływ tzw. kryzysu greckiego na kontynuowanie reformy UE, zwłaszcza w dziedzinie UGiW.