W 2003 roku, jako jedyna uczelnia niepubliczna, uzyskaliśmy także prawo do nadawania stopnia naukowego doktora habilitowanego nauk ekonomicznych w dyscyplinie nauk o zarządzaniu.

W maju 2006 roku nasza uczelnia nadała profesorowi Witoldowi Kieżunowi doktorat honoris causa. Jest to pierwszy w Polsce doktorat honoris causa nadany przez uczelnię niepubliczną.

25 lutego 2008 r. Centralna Komisja ds. Stopni i Tytułów podjęła decyzję o przyznaniu naszej uczelni uprawnień do nadawania stopnia naukowego doktora nauk ekonomicznych w dyscyplinie ekonomia.

25 maja 2009 Centralna Komisja ds. Stopni i Tytułów podjęła decyzję o przyznaniu Akademii Leona Koźmińskiego uprawnień do nadawania stopnia doktora nauk prawnych w dyscyplinie prawo.